ADN environnemental et metabarcoding

- Evaluer le potentiel de l'ADN environnemental et ses champs d'applications
- Comprendre les différentes étapes de l'analyse metabarcoding (phase laboratoire et bioinformatique)
- Acquérir l'autonomie dans des projets requiérant des analyses metabarcoding (rédaction d'articles, manipulation de données ADNe, interprétation...)

I. Introduction
a) Constats
b) Histoire de la technique

I. Principe de la technique
a) Barcoding VS metabarcoding
b) Potentiel
c) Champs d'application
d) Phases de travail

III. Phase laboratoire
a) Extraction d’ADN et test qPCR préliminaire
b) Amplification PCR
c) Vérification et contrôles qualité
d) Préparation de la librairie de séquençage
e) Séquençage NGS

IV. Phase bioinformatique
a) Données brutes
b) Assemblage et premier filtrage
c) Clustering
d) Assignation taxonomique
e) Second filtrage

V. Session questions / réponses

Consulter le diplôme, titre ou certificat... délivrés en fin de formation ainsi que les métiers auxquels cette formation vous donne accès.